こんにちは。
「表示からの削除」は今見ている表示部分から削除するだけで、例えばTuneBrowser内で検索すれば該当の曲が検索結果に出てきますし再生も出来ます。
「データベースからの削除」はTuneBrowserのデータベースから削除するので、該当曲をTuneBrowserで表示したり聴いたりすることが出来なくなります。勿論再登録は何度でも出来ます。
「ディスク上のファイルの削除」は曲ファイル自体を削除することです、つまり曲ファイル自体がwindows上から削除されます。結果だけでみるとwindowsのエクスプローラーから直接ファイルを削除するのと同じで、それをただTuneBrowserを介して行うかどうかという違いです。曲ファイル自体が消えれば当然ですがTuneBrowserで表示することも聴くことも出来ません。メリットとしてはTuneBrowserから「ディスク上のファイルの削除」を行うとTuneBrowserのデータベースからも確実に削除することが出来ます。(「基本の設定」の「音楽ファイルのフォルダ」に登録しているフォルダ、つまり監視対象になっているフォルダ以外の場所から、エクスプローラーからファイルを削除してもデータベースからは自動的に削除されません)
再度リッピングし直すのであれば、以前のリッピングして登録した曲ファイルは「ディスク上のファイルの削除」から削除すればいいと思います。あまり説明がうまくないのですがこれで分かるでしょうか？ご参考になれば幸いです。