たくさん質問を挙げていただきましたが、すいませんがすべて消化はできませんので、ポイントだけご報告します。
再生中にチャンネル数が動的に変わったという事象は、思いつくかぎりでは、トラックが切り替わり、その前後でチャンネル数が変わった場合に発生します。
ただ現在はここが正しく処理できず、チャンネル数は変動するものの、それまで再生していたトラック分しか有効な再生データを送信しません。次のリリースでは、この部分は改善します。
それと、ASIOは、WASAPIとは異なり、ドライバやOS側でチャンネルアサインを管理しません。そのため、TuneBrowserにも手動でチャンネルアサインを指定する設定を用意しています。