こんばんわ。
Bluetoothイヤホンを用意して、操作を試してみました。やはりTuneBrowserで問題なく動作しているようです。
ということは、お書きになられているように、TuneBrowserの設定を変えられた可能性もあるとは思うのですが、上のコメントにも書いたように、イヤホンの操作はキー操作相当に変換されて処理しますので、関係するとすればTuneBrowser内のキーボードの設定です。この設定は少々難しいので、あまり慣れない方は触らないのではないかとも思うのですが、変更された覚えはありますか?