Tokuさん、lame.exeとqtaacenc.exeはTuneBrowserには同梱されていません。
TuneBrowser.exeと同じフォルダ (つまりインストール先) にlame.exeやqtaacenc.exeがある場合は、エンコードツールの部分は指定しなくてもデフォルトの状態で変換できるようになっているので、
エンコードツールのパスを指定したことが今まで一度もないのならば、以前は自身でlame.exeなどをインストール先のフォルダに置いたことはありませんか？
それが現在は、例えば環境を変えた為なくなってしまい変換出来なくなってしまったというようなことはないでしょうか？
そういうことは全くないとなると他にはちょっと思いつかないですね…特定のバージョンにたまたまそれらが入ってしまっていたというようなことがない限り自然に入ることはありえませんし、それも恐らくありえないと思うのですが…