こんばんわ。
ドライブの交換というのは、そう頻繁にあることでもないと思いますので、設定で切り替える機能を用意したとして、果たして使っていただけるのだろうか、という点が正直なところもうひとつピンときません。。設定のデフォルトは作成日時と更新日時の新しいほう、という現在のやり方になると思います。
機能の追加そのものはそう難しくないので、次のリリースに入れたいと思いますが、ドライブ名が同じでファイルの更新日時も同じで、作成日時だけが異なるという検証環境の用意がちょっと難しいかもしれません。
お手数をおかけするのですが、リリースの際には動作確認をお願いしてもよろしいでしょうか?