設定画面でチェック全オフと、チェックありのままVST3ボタンオフとで内部の処理が同等であるとすれば
VST3プラグインの読込みは、VST3ボタンの状態にかかわらず行います。上に書いたように、その上でさらに処理を空転させるようなことは行っていません。
VST3ボタンオフの場合にまったくVST3プラグインにアクセスしないようにすることは、残念ながらTuneBrowserのアーキテクチャ上困難な感じです (設定画面でVST3プラグインに関する処理を行う場合にどうしてもVST3プラグインにアクセスする必要があって、その結果、再生系が保持しているVST3プラグインと競合して問題を起こすVST3プラグインがあったため、TuneBrowser全体で単一のVST3プラグインインスタンスになるようにしたと記憶しています)。